EV 100. sünnipäeva tähistamise ettevalmistuste koordineerimiseks moodustati Vabariigi Valitsuse korraldusega valitsuskomisjon, mille juht oli peaminister ning kuhu kuulusid haridus- ja teadusminister, kultuuriminister, välisminister, kaitseminister, justiitsminister, riigisekretär ja Vabariigi Presidendi esindaja.
Riigikantselei juurde loodi EV100 juhtrühm (Toomas Kiho, Margus Kasterpalu, Tiit Pruuli, Jaanus Rohumaa) ja EV100 korraldustoimkond eesotsas Jaanus Rohumaaga, kelle ülesandeks oli sünnipäeva korraldamine koos Eesti rahvaga. Läbi aegade kuulusid korraldustoimkonda: Jorma Sarv, Maarja-Liisa Soe, Kristo Mäe, Liis Laurits, Elo Aun, Mai Vahtrik, Anneli Ohvril, Heilika Pikkov, Mari Valgepea, Stina Pley, Marju Sokman, Anna Lindpere, Liisi Taremäe, Kristel Tuul, Kerli Rannala ja Merje Klopets.